2012年11月1-2日，中国科学院学部第二次研究支撑机构工作研讨会在北京召开，11个研究支撑机构（含筹建）、院刊编辑部和中国科学院院士局共约50位同志参加。中国科学院学部主席团秘书长曹效业、中国科学院院士工作局局长周德进、中国科学院院士方精云教授、中国科学院自然科学史所所长张柏春研究员、中国科学院地理科学与资源研究所所长刘毅研究员、中国科学院心理研究所党委书记李安林、中国科学院国家科学图书馆常务副馆长张晓林研究员、《中国科学院院刊》执行副主编王兴东等出席了研讨会，会议由院士工作局副局长王敬泽主持。
各研究支撑机构负责人分别汇报了工作进展、主要研究方向及自身建设情况，提出了未来的工作设想和意见建议。院士工作局各处室介绍了部门基本情况，与相关中心联合开展的工作等，咨询处还介绍了中国科学院建设国家科学思想库总体方案的起草情况。会议就学部研究支撑机构建设、中国科学院国家科学思想库建设等进行了热烈讨论，对如何更好地发挥研究支撑机构在科学思想库建设中的作用及支撑机构的合作交流、运行管理等进行了深入研讨。
学部主席团秘书长曹效业指出，建设国家科学思想库要有明确的“一三五规划”，要从前瞻性、系统性、历史性的角度考虑问题，要用科学方法研究社会发展问题，要围绕着“五个如何”与“出深刻思想”的要求来开展工作。秘书长建议在学部创造宽松自由的研究环境，加强各学部常委会与研究支撑机构的合作，调整评价体系。他建议尝试开展为常委会乃至院士定制学部情报平台，以及与科研道德相关的调研等工作。同时，秘书长请各研究支撑机构进一步思考思想库的研究内涵，结合自身优势提出可体现三位一体优势的研究领域。
通过本次会议，总结了研究支撑机构建设的实践经验、促进了相互交流，为更好地发挥研究支撑机构的作用，更好地推进相关工作奠定了基础。
